根据细菌来源可将脑脓肿分为五大类：(1)耳源性;(2)鼻源性;(3)隐源性;(4)损伤性;(5)血源性。常见的化脓性细菌有葡萄球菌、链球菌、肺炎双球菌、厌氧菌、变形桿菌、大肠桿菌等，真菌以隐球菌及放线菌较常见;原虫以溶组织阿米巴常见。