江西省南昌市东湖区福利院康复室管理制度可能因地区和机构的不同而有所差异，但以下是一些通用的管理制度：

1. 安全管理制度：福利机构需要制定安全管理制度，以确保员工的安全，包括员工和设施的安全。该制度可能包括安全操作程序、紧急应对计划、安全培训等。

2. 员工管理制度：福利机构需要制定员工管理制度，以管理员工的工作、培训和发展。该制度可能包括员工招聘、员工福利、员工关系、员工培训等。

3. 康复室管理制度：福利机构需要制定康复室管理制度，以管理员工的康复工作。该制度可能包括康复室的设施、康复流程、康复评估、康复管理等。

4. 管理制度：福利机构需要制定管理制度，以管理整个福利机构的运营。该制度可能包括组织结构、运营流程、财务管理、人力资源等。

以上是一些通用的管理制度，福利机构需要根据具体情况制定适合自己的管理制度。